小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA，主要包括miRNA、piRNA和siRNA等；它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。
小RNA测序目标：
1. miRNA长度，茎环结构，miRNA前体加工，靶基因结合位点和预测；
2. 转录组和小RNA数据的联合分析。

一、技术流程

二、生物信息学分析内容
1. 测序质量分析与统计、评估；
2. microRNA，rRNA，tRNA，intron，exon，snRNA，snoRNA注释；
3. microRNA的表达量差异分析；
4. microRNA表达模式聚类分析；
5. microRNA保守性分析；
6. microRNA与靶基因之间的调控， microRNA靶基因之间的蛋白-蛋白相互作用网络分析；
7. 靶基因预测；
8. 新miRNA预测。

三、结果展示
1. 数据库使用：miRBase Rfam

2. 版图展示

图1.1所示，差异基因聚类热图，反映样品间相似性，以及各miRNA的表达模式相似性；

图1.2所示，预测miRNA；

四、样本要求
总量：〉4 μg RNA；浓度：〉50 ng/μL